四川大学新能源与低碳技术研究院
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计算集群系统的软件安装清单是随着不同软件的安装而随时更新的。这样不论是新接手系统的管理员还是使用者,都可以很快了解系统中安装了哪些什么版本的软件。我习惯安装的软件目录类似“软件名-版本号+编译器-版本号+并行环境-版本号+数学库-版本号……”命名方式。 当用户在/opt/cluster_share/目录下查看安装的软件时,通过目录名即可知道这个软件是什么版本,什么编译器和并行环境编译的,在编译中添加了什么库。关于Linux软件的编译安装,将在提高部分详细介绍。 | 功能 |软件名+版本 | 安装路径 | | :------------ | :------------ | :------------ | | 操作系统 | Centos Linux release 7.9 | | | 集群部署管理工具 | Rockscluster release 7.0 |集群部署管理工具是实验室中rocks基础上改进版本 | |编译器|gcc-11.2.1|/opt/rh/gcc-toolset-11| ||gcc-8.5.0|/opt/cluster_share/compiler/gcc/8.5.0| | | intel2019 | /opt/cluster_share/compilers/intel/2019u4 | | | intel2022.3 | /opt/cluster_share/compiler/intel/2022.3 | | |Anaconda3-2022.10 | /opt/cluster_share/compilers/anaconda3 | |并行环境 | openmpi-4.1.5+intel2019u4 |/opt/cluster_share/mpi/openmpi/4.1.5+ib+intel2019u4+pmix3+ucx-1.15 | || openmpi-4.1.5+intel2022.3|/opt/cluster_share/mpi/openmpi/4.1.5+ib+intel2022.3+pmix3+ucx-1.15| | | openmpi-4.1.5+gcc-4.8.5| /opt/cluster_share/mpi/openmpi/4.1.5+gcc-4.8.5+pmix3+ucx-1.15 | |作业调度 |slurm-24.05.3 |/opt/cluster_share/slurm-24.05.3 | |数学库 |fftw-3.3.10+intel2019u4+openmpi-4.1.5|/opt/cluster_share/mathlib/fftw/3.3.10+intel2019u4+openmpi-4.1.5+pmix3+ucx-1.15| ||blas\lapack\refblas\scalapack\libtmglib|/opt/cluster_share/mathlibs/libs/gcc-8.5.0| ||/openblas-0.3.26|/opt/cluster_share/mathlibs/openblas/0.3.26+gcc-8.5.0| |赝势库|LDA/PBE/GGA|/opt/cluster_share/mathlib/potpaw.54| |工具软件|make-4.3|/opt/cluster_share/tools/make-4.3| ||cmake-3.26.0|/opt/cluster_share/tools/cmake-3.26.0-rc1-linux-x86_64| |计算软件|vasp5.4.4+intel2019u4+openmpi-4.1.5|/opt/cluster_share/apps/vasp/5.4.4+ib+intel2019u4+openmpi-4.1.5+pmix3| ||vasp5.4.4+vtst+intel2019u4+openmpi-4.1.5|//opt/cluster_share/apps/vasp/5.4.4+vtst+ib+intel2019u4+openmpi-4.1.5+pmix3| ||vaspkit-1.4.1|/opt/cluster_share/apps/vasp/vaspkit.1.4.1| ||vtstscripts-1034|/opt/cluster_share/apps/vasp/vtstscripts-1034| ||g16|/opt/cluster_share/apps/g16| ||MS2019|/home/msi/apps/BIOVIA/2019| ||MS2020|/home/msi/apps/BIOVIA/2020| ||ORCA-5.0.3|/opt/cluster_share/apps/orca/5.0.3| ||molpro-2020.1.2|/opt/cluster_share/apps/molpro/2020.1.2|